Kinerja perangkat desa memiliki kontribusi dengan tujuan memajukan organisasi desa, salah satu upaya untuk meningkatkan kinerja yaitu pemanfaatan dan penerapan pada sistem dari informasi dalam bidang akuntansi. Mengetahui pengaruh pemanfaatan dan penerapan sistem informasi akuntansi terhadap kinerja perangkat Desa Junrejo Kota Batu. Penelitian kuantitatif dengan sampel menggunakan Accidental Sampling berjumlah 40 perangkat desa. Teknik pengumpulan data yang digunakan oleh peneliti adalah kuesioner. Hasil penelitian membuktikan bahwa secara parsial pemanfaatan sistem informasi akuntansi berpengaruh signifikan terhadap kinerja perangkat desa dengan nilai thitung = 4,441 dan penerapan sistem informasi akuntansi berpengaruh signifikan terhadap kinerja perangkat desa dengan nilai thitung = 3,748. Adapun yang perlu diperhatikan Kantor Desa Junrejo Kota Batu yaitu menyediakan peralatan kerja yang memadai seperti komputer menggunakan sistem terbaru sehingga mampu meningkatkan kinerja aparat desa.